Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MIS18AQ9NYP9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
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