Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms