Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf4Q9NR00 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms