Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4Q9NQC3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms