Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GOPCQ9HD26 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms