Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNDIG1Q9H7V2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms