Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M3

DEFB129, Beta-defensin 129, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB129Q9H1M3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFB129Q9H1M3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFB129Q9H1M3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms