Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFDQ9GZP0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms