Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZC3H12CQ9C0D7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC3H12CQ9C0D7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms