Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms