Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC8Q9BY41 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDAC8Q9BY41 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms