Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBDC1Q9BVG4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms