Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIN3AQ96ST3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms