Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms