Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD27Q96NW4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms