Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YTHDC1Q96MU7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms