Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC136Q96JN2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms