Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ5

CMTM7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM7Q96FZ5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM7Q96FZ5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM7Q96FZ5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM7Q96FZ5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM7Q96FZ5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM7Q96FZ5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM7Q96FZ5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM7Q96FZ5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM7Q96FZ5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM7Q96FZ5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms