Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms