Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRG4Q92954 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
PRG4Q92954 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms