Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN4Q92575 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms