Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMPDL3AQ92484 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMPDL3AQ92484 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMPDL3AQ92484 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMPDL3AQ92484 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPDL3AQ92484 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms