Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms