Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms