Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC12Q8WUD4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms