Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms