Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms