Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC74

RBBP8NL, RBBP8 N-terminal-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8NLQ8NC74 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8NLQ8NC74 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms