Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SAMD12Q8N8I0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SAMD12Q8N8I0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms