Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC17Q8N6Y2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms