Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVBPQ8N300 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms