Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
HERC6Q8IVU3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms