Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms