Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO2Q7Z6W1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms