Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR88Q6ZMY6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms