Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPTE2Q6XPS3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms