Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C12orf54Q6X4T0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C12orf54Q6X4T0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms