Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OPN5Q6U736 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms