Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms