Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms