Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L1Q676U5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms