Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGNBP1Q5YKI7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms