Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM236Q5W0B7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms