Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms