Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms