Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms