Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COLEC12Q5KU26 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms