Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms