Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM259Q4ZIN3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms