Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVEP1Q4LDE5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms